Prob özellikleri
TBX1, 22q11.2, Kırmızı
N85A3, 22q13.3, Yeşil
TBX1 probu 211 kb'dir, kırmızı ile işaretlenmiştir, tüm TBX1 genini kapsar ve D22S1627 işaretleyicisini içerir. Yeşil renkle etiketlenmiş N85A3 (44kb), 22q13.33 içinde bulunur ve SHANK3 geninin telomerik ucunu kaplayarak en uzak 22q13.3 silmelerinin tanımlanmasına olanak tanır. İki benzersiz dizi, birbirleri için kontrol probları görevi görür ve 22. kromozomun tanımlanmasına izin verir.
Prob bilgisi
DiGeorge Sendromu
DiGeorge sendromu 1 ve Velocardiofacial sendromu (VCFS) 2 dahil olmak üzere çeşitli konjenital malformasyon sendromları , 22q11.2 2,3,4,5'te 22. kromozomun silinmesini paylaşır . Bu kromozom 22 silmeleri, toplu olarak oluşturulan CATCH22'dir; 22. kromozom delesyonuna bağlı olarak kardiyak anormallik, Anormal yüz ifadesi, Timik aplazi, Yarık damak ve Hipokalemi/Hipertiroidizm klinik bulguları.
Ek olarak, izole konotrunkal defektleri olan sendromik olmayan hastaların yaklaşık %29'unda 22q11.2 mikrodelesyonu olduğu gösterilmiştir 6 . Bu anomalilerin insidansının 1:4000 ila 1:9700 canlı doğum 7 olduğu tahmin edilmektedir ve bu nedenle 22q11.2'nin silinmesi en yaygın genetik kusurlardan birini temsil etmektedir.
DiGeorge Kritik Bölgesi (DGCR) olarak anılan yaklaşık 2Mb'lik bir bölge en sık silinen bölgedir ve hastaların %90'a kadarında görülür5,8,9 . DGCR içinde, TUPLE1 (HIRA), TBX1, SLC25A1 (CTP) ve CLTD dahil olmak üzere birkaç gen içeren 300-480 kb'lik minimum bir kritik bölge tanımlanmıştır10,11 .
22q13.3 Silme Sendromu
22q13.3 delesyon sendromu, hipotoni, ifade edici konuşmanın gecikmesi veya yokluğu, genel gelişimsel gecikme, normalden hızlandırılmış büyümeye ve hafif dismorfik özellikler 12,13 ile karakterize edilen tanınabilir bir fenotip sunar .
22q kromozomunun terminal bölgesindeki bazı delesyonlar sitogenetik olarak görülebilir. Bununla birlikte, birkaç şifreli silme vakası bildirilmiştir 12,14 , bu da 22q telomer silinmesinin gerçek insidansının önceden düşünülenden daha yüksek olabileceğini düşündürmektedir.
22q13.3 delesyonu olan hastaların çeşitli gözlemleri, uyarma sinapslarının postsinaptik yoğunluğunun yapısal bir proteinini kodlayan ve beynin korteksinde ve serebellumunda15 ifade edilen SHANK3 (ProSAP2) 20 geninin 15,16,17 bozulduğunu veya silindiğini gösterdi. 18 , bu da onu bu sendrom için aday bir nedensel gen yapıyor. Silme işleminin boyutu 130 kb ile 9 Mb arasında önemli ölçüde değişir 18,19,20 . ARSA geninin distalindeki 22q subtelomerik probların kullanımı bu nedenle tüm 22q13.3 silmelerinin 20,21 incelenmesi için tavsiye edilmiştir.
Kullanım Kılavuzu | İndir |